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안홍일, 이진형, 친양, 우희종, 신공식, 권순종, 임명호
2014 / 한국육종학회지
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Statistical genomics : methods and protocols
Plant genome analysis
Next-generation sequencing data analysis
The brassica oleracea genome
Next generation sequencing : methods and protocols
Genomics and genetics : from molecular details to analysis and techniques
The handbook of plant mutation screening : mining of natural and induced alleles
Genomics-Assisted Crop Improvement.
High-throughput next generation sequencing : methods and applications
Epigenetics protocols
Chromosomal mutagenesis
Genetic mapping and DNA sequencing
Bioinformatics for systems biology
Genomics and proteomics : functional and computational aspects
Chemical genomics
Gene knockout protocols
Transgenesis : methods and protocols
Plant breeding aspects of genomics
Genetics, genomics and breeding of soybean
안홍일; 이진형; 친양; 우희종; 신공식; 권순종; 임명호 · 2014
한국육종학회지
Jin-Hyung Lee; Kong-Sik Shin; Yang Qin; He-Jong Woo; Soon-Jong Kweon; Myung Ho Lim; Hong-Il Ahn · 2014
Korean Journal of Breeding Science
park, Doori; Kim, Dongin; jang, Green; Lim, Jongsung; Shin, Yun-Ji; Kim, Jina; Seo, Mi-Seong; Park, Su-Hyun; Kim, Ju-Kon; Kwon, Tae-Ho; Choi, Ik-Young · 2015
Genomics & Informatics
Daniel R. Kohnen; Hua Sun; John F. DiPersio; Justin King; Yeong Seok Ju; Christopher J. Yoon; Li Ding; Lijun Yao; Amila Weerasinghe; Mark A. Fiala; Steven M. Foltz; Qingsong Gao; Ravi Vij · 2018
Blood
Ji · 2014
Molecules and Cells
Dalla Costa L.,Vinciguerra D.,Giacomelli L.,Salvagnin U.,Piazza S.,Spinella K.,Malnoy M.,Moser C.,Marchesi U. · 2022
European Food Research and Technology
Yu-Ting Tseng; Santhoshi Bandla; Anelia Kraltcheva; Sameh El-Difrawy; Zheng Zang; J. Kilzer; Gary Bee; Dinesh Cyanam; Mohit Gupta; Rajesh Gottimukkala; Warren Tom; Nickolay A. Khazanov; Cristina Van Loy; Paul D. Williams; Elaine Wong-Ho; Chenchen Yang; Janice Au-Young; Scott P. Myrand; Amir Marcovitz; Seth Sadis; Aren Ewing; Vinay K. Mittal; Huimin Xie; James Veitch; Rose Putler · 2020
Cancer Research
Hartwich T.M.P.,Choi S.,Hwang A.,Bellone S.,Palmieri L.,Seo H.,Kim T.,Hong J.,Krakstad C.,Trovik J.,Stefansson I.M.,Haugland H.K.,Greenman M.,Ettorre V.,Ottum S.,Demirkiran C.,Yang-Hartwich Y.,Buza N.,Hui P.,Lopez S.,Cormio G.,Ramunno M.,Zito A.,Perrone E.,Fagotti A.,Fanfani F.,Santoro A.,Ravaggi A.,Bignotti E.,Odicino F.,Ardighieri L.,Ratner E.,Angioli R.,Perrone G.,Luvero D.,Conca B.,Choi J.,Schlessinger J.,Santin A.D. · 2026
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
Boongird A.,Lekcharoensombat N.,Jinawath A.,Theparee T.,Jittapiromsak N.,Shuangshoti S.,Thorner P.S.,Teerapakpinyo C. · 2023
Genes Chromosomes and Cancer
Tanaka, Satomi; Yoshida, Masumi; Natsume, Hideya; Ohashi, Yuka; Takagi, Hiroki; Nishiyama, Chisato; Segawa, Tenta; Kawasaki, Yuto; Takahara, Hiroyuki · 2023
Journal of General Plant Pathology
전선 / 대학원
임목육종을 수행해 나가는 데 있어 실질적으로 대두되는 중요한 문제 또는 이슈들에 대한 이해 및 그 해결방법들을 사례 및 문헌들을 통하여 배우고 토론한다. 구체적으로 최신 임목육종의 국제동향 파악, 수목의 개화와 수정 및 결실과정에 대한 이해, 차대검정을 위한 교배, 검정림 설계와 이를 통한 유전력과 개량효과 추정, 산지시험을 위한 산지의 수집과 시험설계 및 육종구역 설정, 채종원 종류에 따른 조성 및 관리방안 비교, 채종원에서의 자배율 및 화분오염도 추정, 해외 육종성공 사례에 대한 요인 분석 등에 대하여 학습한다. 아울러 장단기 임목육종 계획의 수립 및 육종전략에 대하여 국내외 최신 학술논문 및 연구보고서 등을 읽고 토론한다.전선 / 학사
일반 유전학과 집단 유전학의 기초이론, 수목의 유전적 변이를 초래하는 원인과 유전적 변이의 변화양상, 수목형질의 질적 형질과 양적 형질의 유전양상, 육종의 원리 및 이의 임목 형질 개량에 대한 응용, 선발육종, 교잡육종, 도입육종 등 임목육종 방법들과, 산지시험, 수형목 선발, 차대검정, 채종원 조성 및 다양한 교배방법과 개량된 종묘의 생산 등 선발육종방법의 전 과정에 대한 관련 이론과 기술을 배우며, 우수개체 또는 품종의 증식방법, 특히 조직배양과 형질전환방법과 이 기술을 임목육종에 적용하는 방법에 대하여 강의와 실험을 통하여 배운다.전선 / 학사
미생물, 동물, 식물 등 제반 생물의 유전공학 또는 유전자 재조합 기술 전반에 관한 교육을 수행한다. mRNA 및 DNA의 분리정제, DNA sequencing, DNA 절단 및 ligation, short-gun cloning, cDNA cloning, plasmid 및 cosmid, microinjection 및 세포핵 치환, 세포 융합, hybridoma에 의한 단일체 생산, protein engineering, virus 및 transposable elements, gene expression 및 regulation, DNA replication, transcription, translatioin, 그리고 생산적 응용 등에 관하여 교육한다.전선 / 대학원
최근의 유전체 연구 진보 속도는 매우 빠르며 연구의 내용 또한 비약적으로 변화하고 있다. 작물의 유전체 연구 또한 매우 빨리 진보하고 있으며 새로운 유전체 연구 기술 및 괄목할 만한 연구 내용들이 발표되고 있다. 본 강좌에서는 작물 유전체 해독 연구의 이해 및 이를 바탕으로 한 작물 연구의 향상을 목적으로 최신 유전체 연구 동향 및 신기술들을 소개하고 최신 연구 논문들을 중심으로 작물 연구에 접목하는 분야를 논의한다.전선 / 대학원
개인별 약물유전체학적 정보 및 외인적 요인 등을 통합하여 환자별 맞춤약물요법을 연구하고 적용하는 데 필요한 지식을 습득한다.전선 / 대학원
최근의 작물 품종 개발을 위하여 여러 종류의 DNA마커가 광범위하게 이용되고 있다. 본 강좌에서는 작물을 개량하기 위한 분자마커의 종류, 유전적 다양성 측정, 분자유전자지도 작성, 질적 및 양적 형질 유전자 분석, DNA 마커의 간접선발 이용, 여교잡에서의 DNA 마커의 이용, microarray 시스템을 이용한 분자 유전자지도 제작 및 품종 개발 이용 등에 대하여 이해를 도모하고자 하며, 실제적인 자료 분석을 통하여 종합적으로 DNA 마커를 이용한 작물의 품종 개발 기술 습득을 하는데 본 강좌의 목적이 있음.전선 / 대학원
본 강좌는 대학원생을 위한 고급 구조생물학 교과목으로 (1) 다양한 생화학적, 생물리학적 실험을 기반으로 한 통합적인 구조생물학 (integrative structural biology), (2) 엑스선 결정학 (X-ray crystallography)을 이용한 단백질 구조 연구, (3) 극저온 전자현미경 (Cryo-EM)을 이용한 거대 생체 분자의 구조 연구, (4) 구조적 정보를 해석하기 위한 프로그램 사용법 (PyMol, Coot) 등의 구조생물학 연구에 있어서 유용한 기본적인 구조 분석 및 활용 방법들을 학습하고자 한다. 이를 통해, 생체 내에서 작용하는 다양한 단백질들의 기능과 구조에 대한 상관관계에 대한 이해를 높이고자 한다. 학생들은 실제로 학습한 프로그램을 이용하여 단백질의 구조를 분석하고 이를 발표하는 기회를 갖으며, 생명현상의 이해를 위한 구조생물학적 접근 방법 및 해석에 대해 논의하고 이에 대한 평가를 받는다.전선 / 학사
동물의 형질전환학은 기초 생의학은 물론 농업으로의 응용에 까지 강력한 연구 방법을 제공해 준다. 본 과목에서는 형질전환동물을 만들기 위한 기초로 기초 분자생물학 기법, 초기발생 및 세포생물학에 대하여 강의 초기에 소개하고 이후에는 형질전환동물을 생산하기 위한 기법으로 전핵주입법, 핵이식 기법 및 유전자 적중과 배아줄기세포를 이용한 기법들에 대하여 자세히 소개하고 강의 후반기에서는 이러한 방법들이 생의학과 농업 및 산업분야로의 응용에 대하여 다룰 예정이다.전선 / 대학원
현대 바이오테크놀로지를 가능하게 한 재조합유전자 제작에 관한 기본 원리와 여러가지 절차와 기술을 학습한다. 각종 유전자의 분리와 동정, 운반체, 프로모터, 유전자 은행, 각 단계에서의 유전자 조작법, 형질전환과 선발, 그리고 유전자 조작의 실제 응용 사례등을 공부하여 생물공학의 기본 과정을 종합적으로 이해하게 한다. 후반부에는 학생이 최근 연구논문을 우리말 또는 영어로 발표하여 심층 이해를 돕고, 연구계획 수립에 도움을 준다. 영어 원서. 영어 강의. 2년에 한번씩 개설.전선 / 대학원
식물에 병을 일으키는 병원체들에 대한 분자유전학적 특성 및 이들 병원체와 식물과의 관계에 대한 전반적인 내용을 다룬다. 구체적으로는 곰팡이, 세균 및 바이러스를 중심으로 병원성과 관련된 유전자, 이들의 변이 메카니즘 및 병원체와 식물과의 상호작용에 대한 내용을 분자유전학적 측면에서 살펴본다. 고전적인 유전학에 대한 지식을 바탕으로 분자생물학적 기법을 이용하여 식물병 발생에 관련된 메카니즘을 이해한다.전선 / 대학원
단백질의 서열을 바꾸어 더 좋은 특성을 지닌 단백질을 개발하는 단백질공학은 식품산업에서 사용되는 각종 단백질의 개량을 위해서는 단백질공학이 필요하다. 최근 AI(artificial intelligence) 등의 기술 발달로 a많은 분야에서 이를 활용이 급격히 확대되고 있다. 단백질공학에 AI를 활용하면 기존의 방법보다 더 빠르고 효율적으로 예측할 수 있다. 본 교과목은 기존의 고급 식품단백질공학에 AI를 활용하는 기술을 추가하여 강의한다. 식품 생명공학은 동물, 식물, 미생물의 유전자를 변형하여 더 좋은 생산효율, 판매, 혹은 영향에 관련한 성질을 개량한 신종을 만드는 학문이다. 본 강의에서는 식품산업에서 이용되고 있는 단백질에 초점을 맞추어, 생명공학 기술에 대한 원리와 이를 적용하는 방법에 대해 배운다. 그리고, 현재 식품 산업에서 사용하고 있는 단백질들의 source 확보 방법, 정제방법, 특성분석 방법, 대용량 정제 방법 등에 대해서도 배운다. 또한, 전분 전환산업, 양조업, 식품첨가물 생산업 등의 식품산업에서 생산 혹은 이용되고 있는 각종 단백질을 산업적으로 대량 생산하거나 이용하는 기술 등에 대한 강의도 이루어진다. 특히 인공지능 기반 단백질 구조 예측의 정확도가 획기적인 도약이 있었으므로, 단백질의 3차원 구조를 활용하여 단백질공학을 수행하는 방법에 대한 강의가 이루어진다.전선 / 대학원
본 교과목은 유전체학(Genomics), 전사체학(Transcriptomics), 단백질체학(Proteomics), 대사체학(Metabolomics) 등 최신 오믹스 기술과 이를 통합적으로 활용하여 분석하는 방법에 대해 다루는 강의이다. 고속 시퀀싱, 질량 분석기 기반의 정밀 분석, 생물정보학 도구 등을 중심으로 기술 원리를 이해하고, 실제 식물학, 의학, 생명공학 분야에서의 응용 사례를 살펴본다. 다양한 사례 기반 학습을 통해 복잡한 생물학적 현상을 통합적으로 해석하는 시스템 생물학적 사고를 기르고, 정밀육종, 지속가능한 농업 등에 오믹스 기술을 실질적 활용하는 방법에 대해 탐구한다. 본 교과목은 생명과학 및 분자생물학 기초를 갖춘 대학원생을 대상으로 하며, 연구 및 산업 현장에서 오믹스 전략을 효과적으로 적용할 수 있는 기반 역량을 강화하는 데 중점을 둔다.전선 / 대학원
스마트팜이란 정보통신기술을 적용하여 작물이나 가축의 생육 환경을 최적으로 제어·관리하는 농업 방식이다. 본 교과목에서는 스마트팜에서 재배하는 작물에 관련된 기초 지식과 실용화에 대한 내용을 강의한다. 구체적으로 스마트팜에서 발생하는 환경스트레스와 병해충의 예측 방법, 조기 진단 및 방제 기술을 소개한다. 예를 들어 병해충 발생 및 양분, 광, 수분 등의 재배 조건 변화를 감지할 수 있는 라만 분광법 및 휘발성 2차 대사물질을 감지할 수 있는 zNose 등을 이용하여 환경스트레스와 병해충을 관리하는 기술을 다룬다. 궁극적으로 스마트팜에서 재배되는 작물의 생장 및 생리적 특성에 대한 이해를 높이고 스마트팜에 적합한 작물 개발의 이론적 기초를 제공한다.전선 / 대학원
원예작물은 다양한 병해충의 발생으로 수량이 감소하고 품질이 저하된다. 본 강좌에서 원예작물에 발생하는 다양한 병에 대한 저항성 품종을 위한 전통육종과 생명공학을 이용한 육종의 원리와 최신 연구동향에 대해 배운다. 나아가 식물과 병원체의 상호작용 기작에 대한 이해를 통해 병발생과 식물의 방어기작에 대한 이해를 증진시킨다.전선 / 대학원
법의유전학의 새로운 분야인 forensic DNA phenotyping은 신원을 알 수 없는 사람에 대한 특징을 추정하여 수사에 단서를 제공하는 DNA 분석방법이다. 본 강좌에서는 민족 추정, 외형 추정, 연령 추정에 사용되는 유전자 분석법에 대하여 알아보고, 실제 적용 예에 대하여 고찰하고 토론한다. 학생들은 이 강좌를 통하여 forensic DNA phenotyping의 과정 뿐만 아니라, 제한점과 추정 모델 구축을 위한 통계 분석 방법 등에 대하여 배운다.전선 / 대학원
최근 차세대염기서열분석을 통한 종양 유전체 랜드스케잎의 분석 및 분자생물학적 연구방법의 비약적인 발전으로 종양연구는 한해가 다르게 발전하고 있다. 본 강좌에서는 학생들이 종양유전체학과 정밀의학, 후성유전체 특성, 전사체 연구, 병리연구의 최신지견을 이해하고, 종양 표적 치료 및 항체치료제에 대해 공부한다. 또한, CRISPR를 통한 종양연구의 최신 발표내용을 습득하고, 종양 대사, 지질 및 호르몬, 종양 미세환경의 최신 연구를 학습한다. 종양 오가노이드 및 동물모델 등 중개연구의 최신 발표논문에 대해서 리뷰한다.전선 / 대학원
가축의 육종은 외형적 진화를 설명할 수 있는 유전학적 연구를 위한 최상의 모델이다. 오랜 기간 동안 가축은 인간에 의해 변화되는 환경과 산업적 활용을 위해 유전적 선별이 진행되어 왔다. 이러한 결과로 현재 우수한 경제형질을 가지는 품종이 산업적으로 이용되고 있다. 이러한 효율적인 선발 및 육종을 위한 방법들은 지속적으로 발전을 하고 있다. 가금의 경우에는 지난 100여 년간 산란계와 육용계 품종으로 각각 육종되어 현재 활용 목적에 따라 사육되고 있다. 이에 본 강의에서는 가금의 유전체 분석 및 육종을 위한 기본 개념과 다양한 분석 방법에 대해 제공하고자 한다.전선 / 대학원
돌연변이, 자연도태, 유전적 부동과 이주 등 진화를 초래하는 요인들에 의한 임목 집단의 유전자 빈도 변화양상, 구체적으로는 하디와인버그의 법칙, 작은 집단에서의 유전적 변화, 집단의 유효 개체 수 등과 임목의 양적 형질의 유전양상과 관련하여서는 유전인자간의 상호 작용, 형질의 연속변이와 분산, 육종가, 표현형 분산, 유전적 분산과 그 요소, 유전자형과 환경과의 상호 작용, 유전력, 선발육종의 원리, 선발육종의 결과 및 효과, 개량효과의 추정방법, 근친교배와 원격교배의 결과 등에 관한 이론과 실험결과들에 대하여 배우며 이들 이론과 실험결과를 임목 육종과 삼림유전자원의 보전전략 수립에 적용하는 방법에 대하여 공부한다전선 / 대학원
최근의 유전체학은 2세대 방식의 시퀀싱기를 넘어서는 3세대 방식이 나오고 있다. 3세대 방식의 시퀀싱은 의약학분야와 농축산업과 식품분야에 적용되는 산업화의 기회를 제공하고 있다. 본 과목은 현재 진행되었거나 진행되고 있는 유전체 기술을 이용한 산업화에 대한 자료를 공부하고 발표하는 수업이다. 유전체학의 성과를 산업화하는 성공적이고 가능성 있는 사례를 통해 생명공학 산업에서 유전체학이 가지는 의미를 공부해보는 과목이다.전선 / 대학원
이 과목은 ‘도시통계분석’의 고급과정으로서 도시 연구에서 제기되는 문제들을 계량적으로 분석하는 데 사용되는 방법의 원리와 응용방법을 심도 있게 살펴보는 데 목적이 있다. 이 과목을 수강한 학생들은 계량분석을 이용한 최신의 도시 연구 논문들을 이해할 수 있고, 자신의 연구 질문에 맞는 자료와 분석방법을 이용하여 스스로 접근할 수 있는 능력을 갖추게 될 것이다. 세부적으로 고전적 선형회귀 모형, 일반화 선형모형(generalized linear models), 연립방정식모형(simultaneous equations models), 패널자료 모형(panel data models), 다수준 회귀모형(multi-level regression models), 이산선택모형(discrete choice models), 시계열분석(time series analysis), 공간계량분석(spatial econometrics) 등을 학습하게 된다. 수업시간을 통해 기본 원리를 습득할 뿐만 아니라, 과제를 통해 Stata 등 통계 패키지(학생선택에 따라 R, Python, MATLAB 등을 이용할 수도 있음)를 이용하여 실제 자료에 분석방법을 적용하는 실습을 할 기회를 갖는다.