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Waminal, Nomar Espinosa; Pellerin, Remnyl Joyce; Jang, Woojong; Kim, Hyun Hee; Yang, Tae-Jin
2018 / Plant Breeding and Biotechnology
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본 연구는 인삼의 저배율 유전체 서열 데이터를 활용하여 텔로미어 반복과 두 가지 염색체 특이적 반복 서열을 확인했습니다. 텔로미어 반복 서열은 일반적인 속씨식물 서열과 동일하며, 10번 염색체의 간질 위치를 제외하고 대부분의 염색체 말단에 위치합니다. 또한, 20번 염색체의 장완에 위치하는 PgGA15 미세위성반복과 1번 염색체의 장완에 위치하는 Pgms1 미니위성반복을 확인하여 인삼의 염색체 연구를 위한 마커를 제공합니다.
Next-generation genome sequencing : towards personalized medicine
DNA fingerprinting in plants : principles, methods, and applications
Molecular biology in medicinal chemistry
Chromosomes today
Microsatellites : methods and protocols
Parasite genomics protocols
DNA fingerprinting : state of the science
Forensic DNA profiling protocols
Genomes of plants and animals : 21st Stadler Genetics Symposium
Deep sequencing data analysis
Microsatellites : evolution and applications
Plant transposable elements : methods and protocols
Advances in molecular ecology
Plant bioinformatics : methods and protocols
Arabidopsis protocols
Next generation sequencing : methods and protocols
The ginseng genome
Tiling arrays : methods and protocols
Plant genome analysis
Plant transposable elements : methods and protocols
Plant Breeding and Biotechnology
Hyun Hee Kim; Remnyl Joyce Pellerin; Tae-Jin Yang; Nomar Espinosa Waminal; Woojong JangJournal of Ginseng Research
Waminal, Nomar Espinosa; Choi, Hong-Il; Kim, Nam-Hoon; Jang, Woojong; Lee, Junki; Park, Jee Young; Kim, Hyun Hee; Yang, Tae-JinMolecules and Cells
Joonki Kim, Beom Ho Jo, Kyoung Lyong Lee, 윤의수, Gi Hyung Ryu, 정기화Plant Journal
Choi, Hong-Il; Waminal, Nomar E.; Park, Hye Mi; Kim, Nam-Hoon; Choi, Beom Soon; Park, Minkyu; Choi, Doil; Lim, Yong Pyo; Kwon, Soo-Jin; Park, Beom-Seok; Kim, Hyun Hee; Yang, Tae-JinPlant Journal
Vozárová R.,Wang W.,Lunerová J.,Shao F.,Pellicer J.,Leitch I.J.,Leitch A.R.,Kovařík A.World journal of microbiology & biotechnology
Kabra R; Kapil A; Attarwala K; Rai PK; Shanker AGENETICA
Piscor, Diovani; Paiz, Leonardo Marcel; Baumgartner, Lucas; Cerqueira, Fiorindo Jose; Fernandes, Carlos Alexandre; Lui, Roberto Laridondo; Parise-Maltempi, Patricia Pasquali; Margarido, Vladimir PavanGENES
Aksenova, Anna Y.; Mirkin, Sergei M.Cytogenetic and Genome Research
Romanenko, S.A.; Serdyukova, N.A.; Trifonov, V.A.; Prokopov, D.Yu.; Marchenko, S.A.; Kulak, M.M.; Ilina, A.V.; Galkina, S.A.PLoS ONE
Kim, Kyunghee; Lee, Sang-Choon; Lee, Junki; Lee, Hyun Oh; Joh, Ho Jun; Kim, Nam-Hoon; Park, Hyun-Seung; Yang, Tae-JinHuman Gene
Ahmed, T.S.; Mahmood, K.; Khattak, M.S.N.A.; Rahman, S.U.; Noor, A.; Liang, H.Plant Breeding and Biotechnology
Woojong Jang; Nam-Hoon Kim; Junki Lee; Nomar Espinosa Waminal; Sang-Choon Lee; Murukarthick Jayakodi; Hong-Il Choi; Jee Young Park; Jong Eun Lee; Tae-Jin YangGenes & Genomics
이재완, 이정훈, 조현익, 서아연, 방경환, 최재진, 정종욱, 김영창, 김옥태, 차선우Cytogenetic and Genome Research
Bárbara L.F. Andrade; Ana Luiza G. Lopes; Gisele A. Teixeira; Mara G. TavaresFRONTIERS IN GENETICS
Zattera, Michelle Louise; Gazolla, Camilla Borges; Soares, Amanda de Araujo; Gazoni, Thiago; Pollet, Nicolas; Recco-Pimentel, Shirlei Maria; Bruschi, Daniel PachecoAnnals of Botany
Costa L.,Marques A.,Buddenhagen C.,Thomas W.W.,Huettel B.,Schubert V.,Dodsworth S.,Houben A.,Souza G.,Pedrosa-Harand A.Journal of Experimental Botany
Peska V.,Mátl M.,Mandáková T.,Vitales D.,Fajkus P.,Fajkus J.,Garcia S.International Journal of Molecular Sciences
Romanenko S.A.,Prokopov D.Y.,Proskuryakova A.A.,Davletshina G.I.,Tupikin A.E.,Kasai F.,Ferguson-Smith M.A.,Trifonov V.A.Life Science Alliance
Zhou Y.,Wang Y.,Xiong X.,Appel A.G.,Zhang C.,Wang X.INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
Liehr, Thomas전선 / 대학원
차세대 DNA 염기서열 결정법(next-generation DNA sequencing)을 포함한 분자분석 기술에 대한 최근의 발전은 생물학적 연구의 다양한 영역에 일대 혁신을 일으켰다. 이런 기술들은 연구 패러다임을 바꾸고 있다는 점에서 대기미생물학 연구와 동일하다. 이 과목은 교대로 최근 논문을 읽음으로써 대기미생물학과 보건학에 대한 최근의 이슈를 배우고 공유하는 기회를 제공한다. 대기미생물학 연구에 사용되는 최첨단 기술, 지구온난화에 미치는 공기 중 미생물의 영향, 공기 중 감염질병의 발현이나 공기 중 미생물 인자와 관련된 생물방어(biodefense) 외에도 특정 관심 주제들 포함한다. 선수과목 : 보건대기미생물학개론전선 / 대학원
환경오염 문제를 해결하기 위한 공학적인 접근법을 더 효율적인 것으로 만들기 위해서 다양한 주변 학문들과의 접목이 이루어지고 있으며, 그 중 하나로서 미생물학적 지식을 환경공학 분야에 접목시켜 새로운 융합기술을 개발하는 방안이 대두되고 있다. 따라서 본 교과목의 목표는 환경공학을 전공하는 대학원생들에게 환경미생물학 및 생명공학에 대한 기본적 개념을 확립시키고 나아가 공학에 접목시킬 수 있는 새로운 연구방법을 모색하는데 있다. 본 과정에서는 미생물의 기초, 환경에서 중요한 미생물, 분자생물학적 기초 원리 및 방법 등을 바탕으로 최근 활발한 적용이 이루어지고 있는 생물학적 오염물질 분해, 바이오센서, 바이오연료, 혐기소화를 이용한 유용물질생산 등의 주제에 대해서 다룬다.전선 / 대학원
최근 차세대염기서열분석을 통한 종양 유전체 랜드스케잎의 분석 및 분자생물학적 연구방법의 비약적인 발전으로 종양연구는 한해가 다르게 발전하고 있다. 본 강좌에서는 학생들이 종양유전체학과 정밀의학, 후성유전체 특성, 전사체 연구, 병리연구의 최신지견을 이해하고, 종양 표적 치료 및 항체치료제에 대해 공부한다. 또한, CRISPR를 통한 종양연구의 최신 발표내용을 습득하고, 종양 대사, 지질 및 호르몬, 종양 미세환경의 최신 연구를 학습한다. 종양 오가노이드 및 동물모델 등 중개연구의 최신 발표논문에 대해서 리뷰한다.전필 / 학사
일반생물학을 이수한 학생들을 대상으로, 세포생물학의 중요한 내용을 세포학적 및 분자생물학적 관점에서 접근하는 강의다. 크게 3부분으로 나누어 1. 세포내에서 일어나는 유전정보의 흐름, 2. 세포의 구조와 기능 3. 세포주기와 신호전달 및 암화과정에 대해 다루고자한다.전선 / 대학원
본 강좌에서는 여러 분야의 첨단 바이오 기술 및 장비를 소개한다. 줄기세포 연구 분야에 적용될 수 있는 다양한 새로운 첨단 연구 기법과 기기들을 소개함으로써, 대학원생들의 최신 논문의 이해도를 높이고, 본인의 연구에도 직접 적용할 수 있는 기회를 마련한다.전선 / 대학원
본 강좌에서는 여러 분야의 첨단 바이오 기술 및 장비를 소개한다. 줄기세포 연구 분야에 적용될 수 있는 다양한 새로운 첨단 연구 기법과 기기들을 소개함으로써, 대학원생들의 최신 논문의 이해도를 높이고, 본인의 연구에도 직접 적용할 수 있는 기회를 마련한다.전선 / 대학원
본 강좌에서는 여러 분야의 첨단 바이오 기술 및 장비를 소개한다. 줄기세포 연구 분야에 적용될 수 있는 다양한 새로운 첨단 연구 기법과 기기들을 소개함으로써, 대학원생들의 최신 논문의 이해도를 높이고, 본인의 연구에도 직접 적용할 수 있는 기회를 마련한다.전선 / 대학원
유전공학특론 1과 2를 통하여 습득한 지식을 기본으로 하여 유전공학 관련 최근 발표된 논문들의 내용을 분석 비판하고 유전공학관련 여러 분야에 적용하여 독창적인 연구능력을 함양하도록 한다. 특히 각 수강생들이 각자 수행하는 연구와 관련하여 주제를 도출하여 상기와 같은 방법으로 강의를 진행할 것이다. 본 강좌의 수강생은 유전공학특론 1과 2를 이수한 자이어야 한다.전선 / 대학원
개인별 약물유전체학적 정보 및 외인적 요인 등을 통합하여 환자별 맞춤약물요법을 연구하고 적용하는 데 필요한 지식을 습득한다.전선 / 대학원
본 교과목은 유전자 가위인 TALEN과 CRISPR/Cas를 이용하여 핵, 미토콘드리아 및 엽록체 DNA의 염기 삽입, 결실 및 치환을 유도하는 유전체교정에 대한 기초 지식을 전달하고 최신 연구 동향을 소개한다. 빠르게 발전하고 있는 작물 분야의 유전체교정 연구에 필요한 배경 지식과 실험 기법의 기초 원리 습득을 목표로 한다. 특히 삽입-결실 뿐만 아니라 염기교정 및 프라임교정과 같은 다양한 유전체교정 기술을 자세히 다루며, 인간 세포 기반으로 개발된 최신 유전자 가위의 작물 최적화 방법에 대해 살펴본다. 궁극적으로 작물 유전체교정에 대한 대학원생들의 이해도를 높이고 기후변화 대응에 필요한 환경 적응형 작물 개발에서 응용 가능성과 전망을 소개한다.전선 / 학사
미생물, 동물, 식물 등 제반 생물의 유전공학 또는 유전자 재조합 기술 전반에 관한 교육을 수행한다. mRNA 및 DNA의 분리정제, DNA sequencing, DNA 절단 및 ligation, short-gun cloning, cDNA cloning, plasmid 및 cosmid, microinjection 및 세포핵 치환, 세포 융합, hybridoma에 의한 단일체 생산, protein engineering, virus 및 transposable elements, gene expression 및 regulation, DNA replication, transcription, translatioin, 그리고 생산적 응용 등에 관하여 교육한다.전선 / 대학원
생화학및 분자생물학 분야의 최근 연구 결과들을 주제별로 선택하여 소개하고 토론한다.전선 / 대학원
종양의 침습에 있어 매우 중요한 역할을 하며 실제 다양한 종양의 특성을 이해할 수 있고 치료에의 적용 가능성도 커 최근에 많은 연구가 진행되고 있는 기질의 생물학적 특성에 대해 이해할 수 있도록 한다.전선 / 대학원
공간 전사체학 개론 강의에서는 2010년대 중반 과학방법론에 있어 큰 변화를 일으킨 공간 전사체학에 대해 소개한다. 2023년 현재, 상업적으로 사용가능한 공간전사체 플랫폼으로는 시퀀싱이 필요한 Visium(10X Genomics사), GeoMx(Nanostring사), Stereo-seq(BGI사), Slide-seq(Curio사) 등이 있고 현재 기술 수준으로는 단일 세포 수준에서 또는 세포 내 소기관(Subcellular) 해상도는 구현이 불가능함을 이해한다. In situ hybridization을 기본으로 한 시퀀싱이 필요없는 상업화된 공간전사체 데이터 생산 플랫폼으로는 Xenium(10X Genomics사), CosMx (Nanostring사), MERFISH(Vigen사) 등이 있으며, suspending cell을 이용한 단일세포 전사체 프로파일링 기술과는 달리 수백개 정도의 유전자를 검출할 수 있음을 이해한다.전선 / 대학원
본 강좌는 대학원생을 위한 고급 구조생물학 교과목으로 (1) 다양한 생화학적, 생물리학적 실험을 기반으로 한 통합적인 구조생물학 (integrative structural biology), (2) 엑스선 결정학 (X-ray crystallography)을 이용한 단백질 구조 연구, (3) 극저온 전자현미경 (Cryo-EM)을 이용한 거대 생체 분자의 구조 연구, (4) 구조적 정보를 해석하기 위한 프로그램 사용법 (PyMol, Coot) 등의 구조생물학 연구에 있어서 유용한 기본적인 구조 분석 및 활용 방법들을 학습하고자 한다. 이를 통해, 생체 내에서 작용하는 다양한 단백질들의 기능과 구조에 대한 상관관계에 대한 이해를 높이고자 한다. 학생들은 실제로 학습한 프로그램을 이용하여 단백질의 구조를 분석하고 이를 발표하는 기회를 갖으며, 생명현상의 이해를 위한 구조생물학적 접근 방법 및 해석에 대해 논의하고 이에 대한 평가를 받는다.전선 / 대학원
생명체는 자신의 유전정보를 복제하여 자손에 남김으로써 번식한다. 각각의 세포는 최소 증식 단위이며 세포형태에 따른 특이적 기능을 가지고 있다. 본 교과목에서는 세포의 구조의 특징과 세포 내 존재하는 다양한 물질의 구성 및 구조, 세포와 세포를 둘러싼 환경 사이의 상호 신호 전달 등에 대해 다룰 것이다. 세포의 구조를 다룬 부분에서는 세포를 이루는 생체 원형질막의 구조적 특징과 이를 통한 선택적 투과성과 세포막에 존재하는 다양한 단백질의 기능에 대해 이해함으로써 어떻게 세포가 독립된 공간을 형성하며 살아갈 수 있는 지에 대해 알아볼 것이다. 또한, 세포막을 통한 물질의 수송과 세포 내 단백질의 분류 및 운반 기전에 대해 이해하고 세포 형태를 유지하고 세포의 이동에 관여하는 세포 골격단백질에 대해서도 알아볼 것 이다. 마지막으로 어떻게 세포가 다른 세포나 세포 외 환경과 서로 신호를 교환하는지 알아보기 위해 세포 연접, 부착과 세포 외 기질의 기능 및 역할에 대해 알아볼 것이다.전선 / 대학원
식물에 병을 일으키는 병원체들에 대한 분자유전학적 특성 및 이들 병원체와 식물과의 관계에 대한 전반적인 내용을 다룬다. 구체적으로는 곰팡이, 세균 및 바이러스를 중심으로 병원성과 관련된 유전자, 이들의 변이 메카니즘 및 병원체와 식물과의 상호작용에 대한 내용을 분자유전학적 측면에서 살펴본다. 고전적인 유전학에 대한 지식을 바탕으로 분자생물학적 기법을 이용하여 식물병 발생에 관련된 메카니즘을 이해한다.전필 / 대학원
생물정보학은 생물학, 전산학, 그리고 통계학을 포함한 수리과학에 대한 전반적인 이해를 요하는 학제간 학문이다. 예를 들어 DNA chip 분석 시 생물학을 모르면 data에서 의미를 찾을 수 없음은 물론이고, 통계적 처리를 거치지 않으면 data 분석에 오류가 생기고, 알고리즘에 대한 이해 없이는 더 좋은 분석 기법을 창출할 수가 없는 것이다. 생물정보학에 대한 깊이 있는 이해를 위해서 이러한 기초 지식의 습득은 필수적이라 할 수 있다. 따라서 생물정보학을 배우고자 하는 학생들에게는 선수과목 성격 본 교과목을 이수하는 것을 권장하며, 본 교과목의 목적은 자신의 전공 분야와 무관한 타 학문에 대한 기본적인 지식을 갖추게 하는 것이다.전선 / 대학원
경제를 계량적으로 파악하는 것은 현대 경제학에 있어서 아주 중요한 의미를 갖는다. 이 과목은 대학원에서 계량경제학을 전공하는 학생들이 계량경제학의 중요한 토픽들을 심화하여 이해할 수 있도록 하는 것을 목적으로 한다.전선 / 대학원
손상된 조직재생, 기능을 복원하기 위해 개발되는 저분자, 펩타이드, 단백질, 유전자 치료제 신약에 대한 분류, 신약으로 도출되기 위해 필수로 수행해야하는 시험 및 임상연구에 대한 기초지식을 학습함. 또한 조직복원을 위한 약물융합소재, 생리활성 바이오소재 등에 기반한 의료기기의 설계 및 기능평가 연구에 대해서 학습함.