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Liu S.,Xie L.,Xu L.,Ding F.,Alsaedi A.,Hayat T.
2020 / Journal of the Franklin Institute
Jo K.H.,Park J.,Ryu S.Y.
2020 / Epidemiology and Health
Cunbao Liu, Yufeng Yao, Xu Yang, Hongmei Bai, Weiwei Huang, Ye Xia, Yanbing Ma
2015 / Journal of Microbiology and Biotechnology
Weijian Ren, Mengyu Gao, Chaohai Kang
2021 / International Journal of Control, Automation, and Systems
박수진, 최영임, 장현아, 김상규, 최현모, 강범창, 이효신, 배은경
2021 / Journal of Plant Biotechnology
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본 연구는 현사시나무 원형질체에 정제된 CRISPR/Cas9 리보핵산단백질을 직접 전달하는 DNA-free 유전자 교정 기술을 시연했습니다. PagSAP1 유전자를 타겟으로 하는 세 개의 sgRNA를 설계했으며, 조립된 RNP가 비조립 RNP보다 높은 돌연변이 빈도를 보였습니다. 이러한 결과는 리보핵산단백질 매개 형질주입 접근법이 전유전자 없는 유전자 교정 나무 생산에 유용함을 시사합니다.
Genetic engineering of vegetable crops
Genome editing and global food security : molecular engineering technologies for sustainable agriculture
Plant synthetic biology
Advances in new technology for targeted modification of plant genomes
Genome editing in plants : principles and applications
Plant-microbe dynamics : recent advances for sustainable agriculture
Plant cell culture protocols
Plant tissue culture
Transgenesis : methods and protocols
Plant chromosome engineering
Crop improvement : biotechnological advances
Handbook of new technologies for genetic improvement of legumes
The tangled tree : a radical new history of life
CRISPR crops : the future of food security
Applied plant genomics and biotechnology
Genome editing in drug discovery
Trees II
Yellow biotechnology II : insect biotechnology in plant protection and industry
The production and uses of genetically transformed plants
Oil crop genomics
INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
Badhan, Sapna; Ball, Andrew S.; Mantri, NitinInternational Journal of Molecular Sciences
Bruegmann T.,Deecke K.,Fladung M.Transgenic Research
Bae E.K.,Choi H.,Choi J.W.,Lee H.,Kim S.G.,Ko J.H.,Choi Y.I.Plant Cell Reports
Liu W.,Rudis M.R.,Cheplick M.H.,Millwood R.J.,Yang J.P.,Ondzighi-Assoume C.A.,Montgomery G.A.,Burris K.P.,Mazarei M.,Chesnut J.D.,Stewart C.N.Horticulture Research
Najafi S.,Bertini E.,D'Incà E.,Fasoli M.,Zenoni S.Transgenic research
Ghogare R; Ludwig Y; Bueno GM; Slamet-Loedin IH; Dhingra ABMC Plant Biology
Kim H.,Choi J.,Won K.H.Frontiers in Plant Science
Malnoy, Mickael; Viola, Roberto; Jung, Min-Hee; Koo, Ok-Jae; Kim, Seokjoong; Kim, Jin-Soo; Velasco, Riccardo; Kanchiswamy, Chidananda NagamangalaPLoS ONE
Lee, Nahyun; Park, Jiyeun; Kim, Jung-Eun; Shin, Ji Young; Min, Kyunghun; Son, HokyoungNature protocols
Osakabe Y; Liang Z; Ren C; Nishitani C; Osakabe K; Wada M; Komori S; Malnoy M; Velasco R; Poli M; Jung MH; Koo OJ; Viola R; Nagamangala Kanchiswamy CPlant Biotechnology Reports
Lee Sora; Park Su Hyun; Jeong Jeong Yu; Kim Soyoung; 김보령; 하보근; Na Chaein; Lee Jiyoung; Jeong Jae Cheol; Kim Cha YoungPlant Cell Reports
Liu Y.,Andersson M.,Granell A.,Cardi T.,Hofvander P.,Nicolia A.Frontiers in Plant Science
Hoengenaert L.,Van Doorsselaere J.,Vanholme R.,Boerjan W.Horticulture Environment and Biotechnology
Kang G.H.,Kang B.C.,Han J.S.,Lee J.M.International Journal of Molecular Sciences
Bernard G.,Gagneul D.,dos Santos H.A.,Etienne A.,Hilbert J.L.,Rambaud C.Transgenic Research
Park, Jongjin; Choe, SunghwaPlant cell reports
Kanchiswamy CNSTAR Protocols
Toshihisa Nomura; Mizuki Yoshikawa; Kengo Suzuki; Keiichi MochidaNATURE PLANTS
Toda, Erika; Koiso, Narumi; Takebayashi, Arika; Ichikawa, Masako; Kiba, Takatoshi; Osakabe, Keishi; Osakabe, Yuriko; Sakakibara, Hitoshi; Kato, Norio; Okamoto, TakashiPlant Biotechnology Reports
Lee Myoung Hui, Lee Jiyoung, Choi Seung A, Kim Ye전선 / 대학원
본 교과목은 유전자 가위인 TALEN과 CRISPR/Cas를 이용하여 핵, 미토콘드리아 및 엽록체 DNA의 염기 삽입, 결실 및 치환을 유도하는 유전체교정에 대한 기초 지식을 전달하고 최신 연구 동향을 소개한다. 빠르게 발전하고 있는 작물 분야의 유전체교정 연구에 필요한 배경 지식과 실험 기법의 기초 원리 습득을 목표로 한다. 특히 삽입-결실 뿐만 아니라 염기교정 및 프라임교정과 같은 다양한 유전체교정 기술을 자세히 다루며, 인간 세포 기반으로 개발된 최신 유전자 가위의 작물 최적화 방법에 대해 살펴본다. 궁극적으로 작물 유전체교정에 대한 대학원생들의 이해도를 높이고 기후변화 대응에 필요한 환경 적응형 작물 개발에서 응용 가능성과 전망을 소개한다.전선 / 대학원
본 교과목을 통해 곧 보편적인 임상 적용이 예상되는 유전체교정 기술을 임상의과학 전공자들에게 소개하고 관련 연구의 최신 지견을 탐구하고자 한다. 전반기 강의를 통해 zinc finger nuclease, TALEN, CRISPR-Cas9으로 이어지는 유전체교정 기술 개발의 역사 및 original Cas9, base editing, prime editing 등 CRISPR-Cas9 기반의 기술에 대해 개괄하고자 한다. 이후 후반기 강의를 통해 유전체교정 기술 관련 주요 연구 그룹의 대표 논문 및 적용 관련 최신 논문을 강독함으로써 유전체교정 기술에 대한 이해를 폭넓게 하고자 한다.전필 / 학사
본 과목에서는 학부생을 대상으로 현대 분자생물학에서 사용되는 기본적인 실험 기법과 그 원리에 대해 소개하고자 한다. 수강생들은 과목의 전반부에 걸쳐 PCR, 제한효소 처리 등의 유전자 클로닝 과정을 통해 원하는 재조합 플라스미드 DNA를 제작한다. 과목의 중반부에서는 CRISPR 시스템을 이용한 유전자 편집 기술로 형질전환 식물체 제작 과정을 이해하는 것을 목표로 한다. 그리고 과목의 후반부에서는 RNA 간섭을 이용한 유전자 발현 조절을 mRNA와 단백질 수준에서 확인하는 과정을 다룬다. 수강생들은 직접 실험에 능동적으로 참여하는 과정에서 DNA, RNA와 단백질 같은 생체 고분자를 다루는 방법에 대한 실용적 이해를 습득하게 된다.전선 / 대학원
본 교과목은 유전체 공학과 합성생물학 기술을 기반으로 살아있는 치료제(living therapeutics)로서의 프로바이오틱스 개발을 심화 학습하는 대학원 수준의 과목이다. CRISPR-Cas 기반 유전자 편집, 대사공학, 유전자 회로 설계 등의 기술을 이용하여 질병 치료 및 예방에 특화된 맞춤형 프로바이오틱스를 설계·개발하는 방법론을 다룬다. 아울러, 장내 환경 내 생존성 향상, 생리활성 물질의 생합성, 숙주와의 상호작용 조절 등 기능성 향상을 위한 전략을 기반으로, 기능성 식품 소재 및 건강기능식품으로서의 응용 가능성도 함께 탐구한다.전선 / 학사
일반 유전학과 집단 유전학의 기초이론, 수목의 유전적 변이를 초래하는 원인과 유전적 변이의 변화양상, 수목형질의 질적 형질과 양적 형질의 유전양상, 육종의 원리 및 이의 임목 형질 개량에 대한 응용, 선발육종, 교잡육종, 도입육종 등 임목육종 방법들과, 산지시험, 수형목 선발, 차대검정, 채종원 조성 및 다양한 교배방법과 개량된 종묘의 생산 등 선발육종방법의 전 과정에 대한 관련 이론과 기술을 배우며, 우수개체 또는 품종의 증식방법, 특히 조직배양과 형질전환방법과 이 기술을 임목육종에 적용하는 방법에 대하여 강의와 실험을 통하여 배운다.전선 / 대학원
임목육종을 수행해 나가는 데 있어 실질적으로 대두되는 중요한 문제 또는 이슈들에 대한 이해 및 그 해결방법들을 사례 및 문헌들을 통하여 배우고 토론한다. 구체적으로 최신 임목육종의 국제동향 파악, 수목의 개화와 수정 및 결실과정에 대한 이해, 차대검정을 위한 교배, 검정림 설계와 이를 통한 유전력과 개량효과 추정, 산지시험을 위한 산지의 수집과 시험설계 및 육종구역 설정, 채종원 종류에 따른 조성 및 관리방안 비교, 채종원에서의 자배율 및 화분오염도 추정, 해외 육종성공 사례에 대한 요인 분석 등에 대하여 학습한다. 아울러 장단기 임목육종 계획의 수립 및 육종전략에 대하여 국내외 최신 학술논문 및 연구보고서 등을 읽고 토론한다.전선 / 학사
미생물, 동물, 식물 등 제반 생물의 유전공학 또는 유전자 재조합 기술 전반에 관한 교육을 수행한다. mRNA 및 DNA의 분리정제, DNA sequencing, DNA 절단 및 ligation, short-gun cloning, cDNA cloning, plasmid 및 cosmid, microinjection 및 세포핵 치환, 세포 융합, hybridoma에 의한 단일체 생산, protein engineering, virus 및 transposable elements, gene expression 및 regulation, DNA replication, transcription, translatioin, 그리고 생산적 응용 등에 관하여 교육한다.전선 / 대학원
이 수업은 식물에서 유전자 조절에 관여하는 기능성 non-coding RNA들의 최근 기후변화에 따른 역할에 대한 연구들을 살펴보고 최신 연구 동향을 파악하는 데 목적을 둔다. 수업에서는 범지구적 평균 기온의 상승 및 이상기후의 확대 등 급변하는 기후환경으로 인한 비생물학적 스트레스에서의 long non-coding RNA와 small RNA의 역할, 이와 관련하여 종자 발달과정에서의 기능성 RNA의 역할에 대해 다룬다. 그리고 기후변화에 대응하여 식물의 가소성에서도 많은 변화가 일어나는데, 이 과정에서 RNA의 역할에 대해 다룬다. 또한, 기후변화에 따른 작물보호제에 저항성을 보이는 유해 병·균류의 발생이 증가되는 상황에서 식량 생산 문제 해결의 일환으로 RNAi를 응용한 작물보호제에 대한 이론적 지식을 익히고 최근 연구 논문들에 대한 토론을 진행하는 것으로 수업을 진행한다.전선 / 대학원
DNA는 인간 및 동·식물의 유전정보를 가지고 있는 물질로, 생명체의 모든 신진대사 조절과 성장, 노화, 질병, 유전 등에 관여한다. DNA-RNA-Protein으로 이이지는 과정을 조절하고 제어하는 기술은 매우 중요하다. 특정 유전자만 선택적으로 없애거나 교정할 수 있는 크리스퍼 유전자가위 기술을 포함하여 최근 크게 성장하고 있는 유전질환, 암질환 치료를 위한 세포유전자치료제의 최신 동향과 활용에 대해 소개하고자 한다.전선 / 학사
본 강좌는 생물 정보학 기술을 이용해 특정 유전자를 선발하고, 일련의 분자생물학 실험과 식물조직배양법을 통해 선발된 유전자가 생체 내에서 예측대로 발현되는지 여부를 실험으로 증명하고자 하는 강좌이다. 최신 분자생물학 실험을 수행하고 배지 제조, 기내 배양, 치상 등의 식물조직배양법을 통해 식물체의 형질전환을 실습한다. 또한 이와 관련해 현재 진행되고 있는 식물유전체 연구 및 그 정보를 활용한 유전자 기능연구과정에 대해 알아본다.전선 / 대학원
본 교과목은 DNA 서열의 변화와 상관없이 유전자 발현이 조절되며, 그 결과로 나타난 표현형이 다음 세대로 유전되는 현상을 다루는 후성유전학의 기본 지식을 전달하고 최신 연구 동향을 소개한다. 또한 최근 빠르게 발전하고 있는 작물 분야의 후성유전학 연구에 필요한 배경 지식과 실험 기법의 기초 원리 습득을 목표로 한다. 특히 크로마틴 구조의 변화를 유발하는 DNA 메틸화, 비암호화 RNA 및 히스톤 단백질의 메틸화, 아세틸화, 인산화, 수모화 및 유비퀴틴화와 같은 번역후 수식에 의한 다양한 유전자 발현조절 메커니즘을 자세히 다룬다. 한편 식물 조직 배양의 재분화 과정에서 발생하는 후성유전학적인 체세포 변이에 의한 생명공학작물 개발의 어려움과 극복 방안에 대해 살펴본다. 궁극적으로 작물의 후생유전학적 현상에 대한 대학원생들의 이해도를 높이고 작물 개량에서 응용 가능성과 전망을 소개한다.전선 / 대학원
본 강좌는 대학원생을 위한 고급 계산생물학 교과목으로 (1) 데이터 전처리 및 정규화(RT-PCR/western blotting data normalization), (2) 기본 통계 및 가설검증 방법(hypothesis testing, multiple testing correction, Bayesian 통계 등), (3) 다변량 통계 기반 데이터 시각화 및 회귀분석(주성분분석, 다변량 회귀분석, 주요 변수 추출 등), (4) 오믹스 데이터 기본 분석(데이터 정규화, 매핑, 발현/활성 차이 유전자/단백질 선별), (5) 타겟 분자 예측(마이크로RNA 타겟 예측 등), (6) 다양한 바이오리소스 및 활용 방법(지놈브라우져, 다양한 데이터베이스 및 활용, 생체네트워크 모델링 및 메커니즘 예측) 등의 생물학 연구에 있어서 유용한 기본 분석 및 리소스 활용 방법들을 학습한다. (7) 단백질 예측 (단백질 서열의 특성을 예측하는 in-silico 방법). 학습한 방법들을 적용할 수 있는 텀프로젝트 과제를 부여한다. 이 텀프로젝트에서는 각자 가지고 있는 생물학적 문제에 학습한 방법을 올바르게 적용했는가를 평가한다.전선 / 대학원
최근의 작물 품종 개발을 위하여 여러 종류의 DNA마커가 광범위하게 이용되고 있다. 본 강좌에서는 작물을 개량하기 위한 분자마커의 종류, 유전적 다양성 측정, 분자유전자지도 작성, 질적 및 양적 형질 유전자 분석, DNA 마커의 간접선발 이용, 여교잡에서의 DNA 마커의 이용, microarray 시스템을 이용한 분자 유전자지도 제작 및 품종 개발 이용 등에 대하여 이해를 도모하고자 하며, 실제적인 자료 분석을 통하여 종합적으로 DNA 마커를 이용한 작물의 품종 개발 기술 습득을 하는데 본 강좌의 목적이 있음.전선 / 대학원
다른 과목에서 배운 계량적 분석방법을 현실 농업문제에 응용한다. 비교정학(comparative statics)에 의한 모형분석, 칼만 필터(Kalman filter), 뉴럴 네트워크(neural network), 유전자 알고리즘(genetic algorithm), 부트 스트랩핑(boot strapping), 커널 추정(kernel estimation) 등을 다룬다.전선 / 대학원
본 강의에서는 단백질 화학에 대한 기초 지식을 익히고, 생체 내에서 단백질이 합성되어 소멸되는 과정 및 효소 반응에 대하여 배운다. 먼저 아미노산 및 단백질의 물리화학적 성질과 구조적 특징을 배우고, 둘째로 단백질의 생합성, 변형, 및 소멸에 대하여, 마지막으로 단백질 상호 작용 및 그 연구 방법과 효소 반응의 기본 원리를 배운다.전선 / 대학원
작물디지털육종학에 대한 연구 동향을 숙지하기 위하여 세계적인 학술지에 발표된 관련 전문학술논문을 소개하고 이에 대한 심층적 토의를 한다. 작물디지털육종학의 세계적인 발전 주제를 정밀 분석하고 이들 발전의 뒷받침이 되는 학술적 및 기술적 진보를 추적한다. 주요 강의 내용은 유전자의 구조, 발현 및 조절에 대한 최신 이론 ; 혁신적인 유전적 변이의 창성 방법; 식물과 병원성 미생물간의 상호작용; 및 생명공학적 기법의 육종적 활용 등을 강의한다. 추가로 표현형 정보, 환경 정보 등 다양한 바이오 데이터를 활용하는 머신러닝과 AI 등 디지털 기술을 통해 작물의 형질 발현을 예측하는 기술을 다룬다.전선 / 대학원
본 과목에서는 생명공학에서 나노화학에 이르는 다양한 학문분야의 융합적 이해를 도모하고, 특히 최근 발전하고 있는 게놈 엔지니어링, 대사 공학, 식물생명공학-나노기술 인터페이스 등의 기본 원리를 교육한다. 게놈에디팅을 비롯한 다양한 유전공학 기술과 이를 활용한 식물 대사 리프로그래밍 기술을 교육한다. 추가적으로 다양한 전기적ㆍ화학적ㆍ광학적 특성을 가지는 나노 입자와 생체간 인터페이스를 통해 식물 조직이나 세포소기관에 새롭고 유용한 기능을 부여한 사례와 함께, 식물유래 구조에 기반하여 개발된 생체모방형 재료 및 장치에 대해서도 소개한다. 식물 분자 공학 접근에 기반한 최근 응용기술과 이를 활용한 과학 및 사회적 문제해결 사례에 대해 함께 논의한다.전선 / 대학원
손상된 조직재생, 기능을 복원하기 위해 개발되는 저분자, 펩타이드, 단백질, 유전자 치료제 신약에 대한 분류, 신약으로 도출되기 위해 필수로 수행해야하는 시험 및 임상연구에 대한 기초지식을 학습함. 또한 조직복원을 위한 약물융합소재, 생리활성 바이오소재 등에 기반한 의료기기의 설계 및 기능평가 연구에 대해서 학습함.전선 / 대학원
본 강좌는 대학원생을 위한 고급 계산생물학 교과목으로 (1) 데이터 전처리 및 정규화(RT-PCR/western blotting data normalization), (2) 기본 통계 및 가설검증 방법(hypothesis testing, multiple testing correction, Bayesian 통계 등), (3) 다변량 통계 기반 데이터 시각화 및 회귀분석(주성분분석, 다변량 회귀분석, 주요 변수 추출 등), (4) 오믹스 데이터 기본 분석(데이터 정규화, 매핑, 발현/활성 차이 유전자/단백질 선별), (5) 타겟 분자 예측(마이크로RNA, 전사인자 타겟 예측 등), (6) 다양한 바이오리소스 및 활용방법(지놈브라우져, 다양한 데이터베이스 및 활용, 생체네트워크 모델링 및 메커니즘 예측) 등의 생물학 연구에 있어서 유용한 기본 분석 및 리소스 활용 방법들을 학습한다. 학습한 방법들을 적용할 수 있는 텀프로젝트 과제를 부여한다. 이 텀프로젝트에서는 각자 가지고 있는 생물학적 문제에 학습한 방법을 올바르게 적용했는가를 평가한다.전선 / 대학원
ᅠ단백질은 물리 화학적 반응의 제어, 세포 신호 전달, 면역체계, 물질 전달, 구조적 기능을 아우르는 매우 다양한 기능을 담당함. 따라서 단백질 공학 기술을 통해 단백질이 가지고 있는 본래의 기능을 강화 (또는 약화)하거나, 본래 없는 신규한 기능을 가지는 단백질을 만드는 것은 매우 큰 학문적, 산업적 가치를 가짐. 또한 최근 다양한 항체 의약품, ADC 및 펩타이드 의약품 등 기존의 저분자 화합물의 단점을 극복할 수 있는 단백질 의약품이 주목을 받고 있음. 다른 소재에 비하여 단백질이 가지고 있는 내재적인 복잡성 때문에, 단백질의 기능을 변화시키거나 새로운 기능을 갖는 단백질 의약품을 디자인 하는 것에는 매우 큰 어려움이 있었음. 그러나 최근에는 인공지능을 통한 단백질 구조 예측 정확도가 크게 향상되었고, cryo-EM으로 대표되는 고해상도 단백질 구조 규명 방법론의 발달 (인공지능을 통해 디자인한 구조의 실험적 검증) 등을 통하여 단백질 공학 기술은 매우 빠른 속도로 발전하고 있음. 본 강의에서는 최신 단백질 공학 기술을 이해하기 위해 필요한 단백질 구조, 접힘(folding), 단백질 구조와 기능 간의 상관관계 등 기초지식을 학습함. 단백질 의약품의 약물성 및 효능 개량을 위해 사용되는 다양한 단백질 공학 방법론(rational design vs irrational protein engineering (directed evolution 등))을 소개하고, 산업 영역에서 실제 사용되는 단백질 공학 기술의 응용(항체 엔지니어링 등)에 관한 최신 기술을 학습함. 또한 실제 약물 타겟에 결합하는 펩타이드 바인더 서열 및 구조를 디자인하고, 이를 알파폴드와 알파폴드 멀티머와 같은 프로그램을 사용하여 구조를 예측하는 실습을 진행할 예정임.