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Selective fluorescent chemosensor for the bacterial alarmone (p)ppGpp

Author

Rhee, Hyun Woo; Lee, Chang-Ro; Cho, Seung-Hyon; Song, Mi-Ryung; Cashel, Michael; Choy, Hyon E.; Seok, Young-Jae; Hong, Jong-In

Journal Title

Journal of the American Chemical Society

Publication Year

2008

Topics

#Fluorescence
#Chemistry

Summary

This study developed the first selective fluorescent chemosensor (PyDPA) for (p)ppGpp, a bacterial and plant alarmone. PyDPA shows very good selectivity for (p)ppGpp from among other nucleotides in water and was used for the real-time detection of in vitro ppGpp synthesis by bacterial ribosomal complexes.

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Make and break the alarmone: regulation of (p)ppGpp synthetase/hydrolase enzymes in bacteria

Ronneau, Severin; Hallez, Regis · 2019

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바이오모니터링과 인체노출평가 보건대학원 환경보건학과
전선 / 대학원
다양한 환경오염물질에 노출되어 건강영향을 야기하려면 체내흡수가 이루어져야한다. 환경매체중 물질의 함량과 접촉을 조사하는 노출모델(exposure model)과 약동력학(pharmacokinetics)를 이용한 노출량 추적 및 노출시뮬레이션, 인구집단 바이오모니터링연구 기획 및 분석절차와 자료 해석을 제대로 수행하기 위해 인체노출평가는 생체지표(biomarker)를 측정하여 노출과 건강영향을 연결하고 이해하는데 필요한 원리를 체계적으로 학습할 수 있도록 기획되었다. 산업보건학과 환경보건학분야에서 축적된 경험과 지식을 학 학문적 원리로 정리하고 기념비적인 학술연구와 최신연구경향을 담은 논문을 리뷰하면서 인체노출평가의 원리와 실제를 학습한다.
- # Biomonitoring
- # Environmental health
- # Pharmacokinetics
유기화학 1 공과대학 화학생물공학부
전필 / 학사
유기화학의 기초지식을 습득하고 화합물들의 입체구조 및 제법과 아울러 각각의 반응성 등을 배운다. 첫째, 알칸족, 알켄족, 알킨족 등의 탄화수소화합물의 구조와 제법. 둘째, 할로겐 화합물과 친핵치환반응 및 친핵제거반응. 셋째, 입체 화학. 넷째, 에테르 및 에폭시화합물. 다섯째, 알콜 화합물의 제법과 성질 등을 강의한다.
- # Chemistry
- # Organic chemistry
- # Halogen
생체 및 생화학신호 센서 의과대학 의과학과
전선 / 대학원
이 수업은 생체 및 생화학적 신호를 감지하고 해석할 수 있는 센서 기술의 기본 개념을 이해하고, 이를 실제 의과학 및 헬스케어 분야에 응용할 수 있는 능력을 배양하는 것을 목표로 합니다. 특히 화학·전기화학·광학적 원리를 기반으로 한 센서 동작 메커니즘과, 생체적합 소재 및 인터페이스 설계에 대한 기초 지식을 다루고자 합니다. 세부적으로는 1) pH, 이온, 단백질, 대사체 등 다양한 생화학 신호를 측정할 수 있는 센서 원리, 2) 생체환경에서 안정적으로 작동할 수 있는 고분자, 나노소재 및 표면개질 기술, 3) 측정된 신호를 의료·디지털 헬스케어 및 진단 시스템에 연결할 수 있는 응용 사례 등을 포함합니다. 이를 통해 수강자는 단순한 측정 기술의 이해를 넘어, 생체신호를 활용한 융합적 연구를 주도할 수 있는 기초 역량을 갖추게 될 것입니다.
- # Nanotechnology
- # Biochemistry
- # Chemistry
바이오센서 농업생명과학대학 바이오시스템공학과
전선 / 대학원
바이오센서의 작동원리를 이해하고 이를 실제 농산가공, 식품산업, 생명공학 분야에 응용하는 사례를 강의하여 공학도로서의 현장적용 및 연구 활동을 위한 적용 능력을 배양한다
- # Biosensing technique
- # Nanotechnology
검출 및 추정 공과대학 전기·정보공학부
전선 / 대학원
강좌에서는 Bayes, MAP, Neyman-Pearson, MMSE 등의 검출 이론과 이의 추정에 대해 다룬다. 또한 최적 수신기의 성능과 이의 분석을 다룬다.
- # Computer Science
유기화학 2 공과대학 화학생물공학부
전필 / 학사
유기화학의 기초지식과 기초분광법을 이용한 관능기들의 정성분석법 등을 강술한다. 첫째, UV, IR, NMR, mass spectrum을 이용한 유기화합물의 정성분석 기초이론. 둘째, 방향족화합물의 종류와 성질, 셋째, 방향족화합물과 친전자 치환반응, 넷째, 유기산의 제법과 성질. 셋째, 알데히드 및 케톤기를 갖는 화합물의 성질. 다섯째, 아민기를 갖는 화합물. 여섯째, 유기금속 화합물과 공업적 이용. 그 외 헤테로고리 화합물의 종류와 성질 등을 강의한다.
- # Chemistry
- # Organic chemistry
- # Aldehydes
기초연구를 위한 자기공명분광 – 이론과 실습 의과대학 의과학과
전선 / 대학원
자기공명분광(Magnetic Resonance Spectroscopy (MRS))을 활용하여 여러 질병들의 발병기전 및 진화에 대한 기초연구를 수행할 수 있는 지식(이론과 실습)을 습득함. 이론은, 다양한 신경 정신질환과 관련이 있는 것으로 알려져 있는 myo-inositol, gamma-aminobutylic acid (GABA), glutamate 등의 측정법을 포함함. 실습은, 소프트웨어를 통해 쥐(rat)의 두뇌 스펙트럼에서 뇌 대사체들을 정량분석하는 과정을 포함함.
- # Spectroscopy
- # Glutamate receptor
치의재생 치료 신약 및 신개발 의료기기 설계 기초 치과대학 치의과학과
전선 / 대학원
손상된 조직재생, 기능을 복원하기 위해 개발되는 저분자, 펩타이드, 단백질, 유전자 치료제 신약에 대한 분류, 신약으로 도출되기 위해 필수로 수행해야하는 시험 및 임상연구에 대한 기초지식을 학습함. 또한 조직복원을 위한 약물융합소재, 생리활성 바이오소재 등에 기반한 의료기기의 설계 및 기능평가 연구에 대해서 학습함.
- # Medical device
- # Drug
- # Clinical research
바이오센서 응용 및 실험 농업생명과학대학 바이오시스템·소재학부
전선 / 학사
센서의 기본 개념과 바이오센서의 특징, 작동원리, 신호처리 회로기술을 이해하고 기본 구조의 센서 및 회로 제작과 적용 실습을 통해 공학도로서의 연구 수행 능력을 발전시킨다. 또한 식품 안전성, 환경 모니터링, 질병진단, 그리고 스마트팜 분야에서의 활용 사례를 학습하여 다양한 현장 적용 능력을 배양한다.
- # Biosensing technique
- # Signal processing
물리화학적 처리공정 공과대학 건설환경공학부
전선 / 대학원
이 과목에서는 정수장이나 하수처리장에서 일반적으로 채택되고 있는 물리화학적 공정에 대한 이론과 설계방법을 강의한다. 반응조의 해석 및 설계, 입자의 거동과 특성에 대한 기본적인 이론을 설명한다. 전통적인 처리공정인 응집, 침전, 부상, 여과, 소독, 농축 등에 대한 공정의 발달과정을 설명하고, 최신의 이론 및 동향, 그리고 설계방법등을 강의한다. 또한 막, 탈기, 흡착등과 같은 특별한 공정에 대하여 선택적으로 설명하게 된다. 이 과목을 수강한 후에는 기존 공정의 설계나 운전시에 대하여 비판을 하고 새로운 해결책을 제시할 수 있으며, 이론을 응용하여 새로운 처리공정을 개발하는데 도움이 될 것이다.
- # Chemical process
- # Physical chemistry
- # Physics and Astronomy
방사성동위원소 생산 및 응용 공과대학 에너지시스템공학부
전선 / 대학원
의학 및 산업 분야 전반에 걸쳐 다양하게 활용되고 있는 방사성동위원소의 생산 방법 및 활용 범위에 대해서 소개하고, 연구용 원자로 및 사이클로트론, 입자가속기, 핵파쇄 중성자원 등 방사성동위원소 생산에 활용되고 있는 국내외의 다양한 방사선 발생장치들의 작동원리 및 운용현황에 대해서 소개한다. 반도체 및 우주 산업 등 방사성동위원소가 활용되고 있는 다양한 분야의 연구 동향에 대해서 탐색하고, 방사성동위원소 응용 기술의 저변 확대와 기술 개발 가능성 등에 대해서 논의한다.
- # Isotope
- # Particle accelerator
- # Radionuclide
기기분석 공과대학 화학생물공학부
전선 / 학사
본 기기분석 과목은 물질의 정성 및 정량 분석을 위해 다양한 분석 장비와 원리의 이해를 제공한다. 수업에서는 X-ray Diffraction, Atomic Absorption/Emission/Mass Spectrometry, UV-VIS Spectrometry, Molecular Luminescence Spectrometry, Raman Spectroscopy, Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, Surface Characterization by Spectroscopy 등의 분석 기법들에 대해 소개한다. 또한 다양한 분석 기기의 구조와 작동 원리 등을 소개하고 이를 통해 이러한 기기분석법의 분석 한계, 정밀도 및 신뢰성에 대해 강의한다.
- # Mass spectrometry
- # Nuclear magnetic resonance
- # Atomic absorption spectroscopy
치과재료용 기기분석학 개론 치과대학 치의과학과
전선 / 대학원
금속, 세라믹, 고분자, 및 복합체는 임플란트용, 치수복용, 보철용, 교정용 소재 등 치과학의 각 영역에서 다향하게 사용되고 있다. 이 강의는 임상에서 사용되는 다양한 소재의 물리적/화학적/생물학적 물성을 정확히 이해할 수 있는 기기분석법을 학생들에게 교육하여 환자의 진료 및 연구에 적극 응용할 수 있게 함을 목적으로 한다.
- # Dentistry
- # Analytics
방사성동위원소 생산 및 응용 공과대학 에너지시스템공학부
전선 / 대학원
의학 및 산업 분야 전반에 걸쳐 다양하게 활용되고 있는 방사성동위원소의 생산 방법 및 활용 범위에 대해서 소개하고, 연구용 원자로 및 사이클로트론, 입자가속기, 핵파쇄 중성자원 등 방사성동위원소 생산에 활용되고 있는 국내외의 다양한 방사선 발생장치들의 작동원리 및 운용현황에 대해서 소개한다. 반도체 및 우주 산업 등 방사성동위원소가 활용되고 있는 다양한 분야의 연구 동향에 대해서 탐색하고, 방사성동위원소 응용 기술의 저변 확대와 기술 개발 가능성 등에 대해서 논의한다.
- # Isotope
- # Particle accelerator
- # Radionuclide
생체방어기전 약학대학
전선 / 대학원
생체에서 활성화되는 화학물질 중 free radical을 일으키는 물질은 자연계에 많이 존재하는데 인체내에서 free radical의 생성반응, 검색방법 및 각 조직별 독성 반응의 특징에 대해 강술한다. 또한 이러한 공격을 차단할 수 있는 defense system을 공부하여 free radical의 생체공격과 질병과의 상관성에 대해 토론한다.
- # Computational biology
핵자기공명 분광학 및 실습 농업생명과학대학 농생명공학부
전선 / 대학원
핵자기공명 분광학은 생체 분자에 대한 구조 정보뿐 아니라, 생체 내 반응에 대한 반응 속도, 평형 상수 등 중요한 동력학 정보를 제공한다. 이 강좌에서는 핵자기공명 기본 지식과 저분자 및 고분자 구조 결정 방법, 상호 작용 및 반응 속도 분석, in vivo NMR 등 다양한 기법의 원리와 최신 동향을 익힌다.
- # Nuclear magnetic resonance
- # Spectroscopy
- # Reaction dynamics
생물학적 처리공정 공과대학 건설환경공학부
전선 / 대학원
자연현상과 환경기술로서 생물학적 처리공정을 학습하며, 특히 생물학적 폐수처리공정을 중점적으로 다룬다. 생물학적 처리공정의 이론과 최근에 개발된 기술을 위시한 다양한 처리기술을 대상으로 공부하며, 생물학적 처리시설의 계획, 설계, 해석과 운영 및 관리방법에 관하여 학습한다. 생물학적 처리공정의 이해를 증진시키고 체계적인 해석을 추구하기 위하여 생화학반응과 물질전달을 반영하는 수학적 모형을 공정별로 도입하여 학습에 이용하고 시설설계와 운영 및 해석 등의 공학적 활용방안을 검토한다.
- # Environmental engineering
- # Engineering
- # Environmental Science
유기정밀화학 공과대학 화학생물공학부
전선 / 학사
이미 습득한 유기화학 기본지식 위에 기초적인 유기합성의 전략과 방법을 강의한다. 이미 배운 각종 관능기에 대한 화학을 재정리하여 준 다음 산화반응, 환원반응, 보호원자단 도입방법 및 제거방법 등을 포함한 관능기들의 상호교환 방법을 강의한다. 기초적인 탄소와 탄소사이의 결합방법과 합성반응에 유용하게 쓰이는 보론, 인, 실리콘 등을 포함한 각종 유기시약에 대해서 그 반응특성에 대해 살피고 이들을 이용한 합성 예를 몇가지 강술한다.
- # Chemistry
- # Organic chemistry
- # Fine chemical
고급도시계량분석 환경대학원 환경관리학과
전선 / 대학원
이 과목은 ‘도시통계분석’의 고급과정으로서 도시 연구에서 제기되는 문제들을 계량적으로 분석하는 데 사용되는 방법의 원리와 응용방법을 심도 있게 살펴보는 데 목적이 있다. 이 과목을 수강한 학생들은 계량분석을 이용한 최신의 도시 연구 논문들을 이해할 수 있고, 자신의 연구 질문에 맞는 자료와 분석방법을 이용하여 스스로 접근할 수 있는 능력을 갖추게 될 것이다. 세부적으로 고전적 선형회귀 모형, 일반화 선형모형(generalized linear models), 연립방정식모형(simultaneous equations models), 패널자료 모형(panel data models), 다수준 회귀모형(multi-level regression models), 이산선택모형(discrete choice models), 시계열분석(time series analysis), 공간계량분석(spatial econometrics) 등을 학습하게 된다. 수업시간을 통해 기본 원리를 습득할 뿐만 아니라, 과제를 통해 Stata 등 통계 패키지(학생선택에 따라 R, Python, MATLAB 등을 이용할 수도 있음)를 이용하여 실제 자료에 분석방법을 적용하는 실습을 할 기회를 갖는다.
- # Econometrics
- # Linear regression
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종양면역 의과대학 의과학과
전선 / 대학원
종양과 관련된 면역 과정과, 면역치료에 대한 전반적인 이해와 개론에 대한 강의를 한다.
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Selective fluorescent chemosensor for the bacterial alarmone (p)ppGpp

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